Durch unterschiedliche Stiftungen und die Landesgraduiertenförderung der Freien und Hansestadt Hamburg (FHH) wird die HCU regelmäßig in die Lage versetzt, Promotionstipendien zu vergeben. Die jährliche Vergabe von Promotionsstipendien der FHH findet in der Regel im Frühjahr statt. Durch die Unterstützung der hochschulübergreifenden Förderinitiative ProExzellenzia (www.pro-exzellenzia.de) werden derzeit unterschiedliche Promotionsprojekte von Doktorandinnen in den MINT-Fächern an der HCU gefördert. Die Sutor-Stiftung fördert Promovierende an der HCU u.a. durch die Bereitstellung von Stipendien und der Ausschreibung eines Promotionspreises.

Promotionsstipendien, die der HCU zur Verfügung gestellt werden, werden in der Regel vom Promotionsausschuss ausgeschrieben und vergeben.